Urodził się w roku 1890 we wsi Kvasice (powiat Kromieryż w Czechosłowacji), w rodzinie wyznania rzymsko-katolickiego. Jego rodzicami byli Piotr i Wincencja. Ukończył pięć klas szkoły ludowej, po czym wyuczył się na muzyka.
W dniu 12 września 1912 powołany do armii austro-węgierskiej i wcielony do Galicyjskiego Pułku Piechoty Nr 77. W szeregach tego pułku uczestniczył w zmaganiach I wojny światowej, walcząc do 1917 na froncie rosyjskim. Do 28 października 1918 pozostawał żołnierzem 77 pułku piechoty c. i k. armii awansując do stopnia kaprala.
W dniu 15 listopada 1918 wstąpił ochotniczo w Jarosławiu (gdzie wówczas mieszkał) do odrodzonego Wojska Polskiego i otrzymał przydział do 14 pułku piechoty. 1 lutego 1919 awansowany do rangi plutonowego, a 1 kwietnia tr. do stopnia sierżanta. Od dnia 26 sierpnia 1919 w szeregach 14 pp uczestniczył w wojnie polsko-bolszewickiej. Rozkazem Dowództwa Okręgu Generalnego w Łodzi z 23 lutego 1921 został zatwierdzony jako podoficer zawodowy z dniem 6 sierpnia 1920. 1 maja 1921 przybył wraz z 14 pułkiem piechoty do Włocławka, który stał się pokojowym garnizonem pułku (wcześniej, po zawieszeniu broni w wojnie z Rosją Radziecką, stacjonował wraz z pułkiem w Zambrowie).
W okresie międzywojennym nadal służył w 14 pułku piechoty. Rozkazem Dowództwa 4 Dywizji Piechoty z dnia 1 października 1922 został przemianowany na podoficera zawodowego – w orkiestrze włocławskiego pułku. Deklarował znajomość języków: polskiego, czeskiego i niemieckiego.
27 czerwca 1927 podczas posiedzenia Komisji Rewizyjnej dla obliczeń wysługi lat przy D.O.K. VIII w Toruniu zaliczono sierżantowi Franciszkowi Janiszowi służbę w Wojsku Polskim od dnia 1 listopada 1918, w tym w randze sierżanta od 1 stycznia 1919.
W okresie późniejszym awansowany do stopnia starszego sierżanta.
Rozkazem organizacyjnym Nr 1 Dowództwa 14 pułku piechoty z dnia 16 września 1930 starszy sierżant Franciszek Janisz przydzielony został do orkiestry włocławskiego pułku. W stan spoczynku przeszedł najprawdopodobniej przed dniem 1 kwietnia 1932.
Dalsze jego losy pozostają nieznane.
W dniu 10 października 1917 Franciszek Janisz zawarł związek małżeński z Katarzyną Wilkon.
